L'ÉGLISE AUJOURD'HUI
Après toutes ces destructions et reconstructions, voyons à quoi ressemble l'église actuelle. Il est logique d'y retrouver plusieurs styles architecturaux : le style roman d'origine et le style gothique plus tardif, mais avant de décrire plus en en détail cette monumentale église, voici un schéma général pour faciliter la visite : des éléments de style roman, donc les plus anciens, se trouvent dans les parties en orange et les zones dessinées en vert ont été plusieurs fois modifiées au cours des siècles.
LE CLOCHER-PORCHE :
C'est une des parties les plus anciennes de l'église.
Devant la porte permettant l'accès à l'église, un porche surmonté d'une coupole circulaire dans une tour carrée d'environ 8 mètres de côté, correspondant au clocher. L'extérieur du clocher est austère, sans autre "décoration" que des contrefrorts plats d'une trentaine de centimètres de largeur et de quelques cm d'épaisseur.
Sur la face sud du clocher, on remarque la trace d'un bâtiment pointu accolé à l'église (sans doute une partie du monastère) et deux fenêtre géminées, fournissant un peu de lumière à l'escalier intérieur qui donnait accès au clocher.

Ce porche constitue le narthex , l'endroit où se tenaient les non baptisés pendant la Messe (puisqu'ils ne pouvaient pas pénétrer dans l'église).
Les murs ont environ 1.50m d'épaiseur et on peut remarquer le dallage usé par les pieds des fidèles. Le porche comporte quatre ouvertures en arc roman, selon les quatre points cardinaux : à l'est, la porte d'entrée vers l'église et à l'ouest, au nord et au sud, trois ouvertures autrefois fermées par des portes qui ont été enlevées comme le signale un article de la Société Historique et Archéologique du Périgord (SHAP) : F. Salviat y signale que l'architecte des Monuments Historiques a décidé l'enlèvement de trois portes anciennes, fermant le narthex roman de l'église de Paunat. Le vestibule clos jusqu'ici est donc ouvert à tous vents. Une pétition et une lettre ont été envoyées au ministre de la Culture par certains habitants et amoureux de Paunat: ils demandent la réinstallation des vantaux déposés (dossier déposé à la bibliothèque de la SHAP), BSHAP 2010 p23).
LA NEF :
Elle a dû être restaurée, voire reconstruite, à plusieurs reprises puisqu'elle a subi maintes attaques au cours des siècles. Actuellement, on observe des arcs en forme d'ogives qui ne soutiennent rien : en effet, les voûtes avec un remplissage en plâtre et briques datant du XIXe siècle se sont écroulées laissant voir la charpente. La toiture et les arcs ont été restaurés mais les voûtes n'ont pas été refaites.
Selon certains auteurs comme Felix de Verneilh, la voûte de la nef aurait eu à l'origine trois coupoles, ce qui ferait cinq avec celle du porche et celle de la croisée des transepts. Cette église pourrait donc appartenir au style byzantin tout comme Saint Front à Périgueux ou Saint Nicolas à Trémolat.